根據國家局《關于保健食品產品申報有關事項的通知》（食藥監辦許[2011]17號），自2011年2月1日起，申報保健食品的電子填報方式及填報信息有所改變。

一、國產類產品，啟用網上填寫申報信息的方式，各省局受理機構在受理時不再接收由原企業版填寫并存儲的文件。由本網站[網上申報]欄目中“國產保健食品注冊填寫”進入。

國產的新產品注冊申報、變更批件、產品技術轉讓和再注冊等申請均由網上填寫申請表信息、打印申請表。網上提交后，將紙質文件交省局受理機構。

僅變更申報單位名稱和地址，仍按變更批件填寫，由系統區分是否屬于備案。備案申請信息填寫打印并確認后，將信息保存在存儲介質上，與紙質資料一并交予國家局行政受理服務中心。

二、進口類產品，仍使用企業版離線填寫，見本網站[網上申報]欄目中“進口保健食品申報版下載”。申請信息填寫打印并確認后，將信息保存在存儲介質上，與紙質資料一并交予國家局行政受理服務中心。

三、根據國家局《關于印發保健食品產品技術要求規范的通知》（國食藥監許[2010]423號），申報國產和進口保健食品均需提交產品技術要求的電子文檔（WORD的DOC文件）。方法暫定為：產品受理后，在本網站[審評進度]欄目內“保健食品”中選擇“技術要求填寫”，補填產品技術要求的電子信息并上傳文檔。